Репликация ретровирусов

Grandgenett D. , 1980]; анализ пептидных и аминокислотных последовательностей фермента показал, что а- и {3-субъединицы гомологичны, однако они в процессе обратной транскрипции вирусного генома выполняют разную роль. Предполагается, что р-субъединица обеспечивает взаимодействие фермента с матрицей, а а — осуществляет транскрипцию. Образование а-субъединицы происходит в результате процессирования (3-субъединицы протеа-зой р15, кодируемой геном gag [Ghysdael J. et al. , 1981]. В ходе процессирования (3-субъединицы образуется также В-фрагмент, функция которого неизвестна. При обработке а-субъединицы химотрипсином образуется А-фрагмент, с которым связана активность РНКазы Н. Процесс обратной транскрипции генома ретро-вирусов птиц сопровождается фосфорилированием р-субъеди-ницы, однако влияние этой реакции на функцию фермента не известно [Gerard G. , Grandgenett D. , 1980; Moelling К. et al. , 1980].

Уникальность ДНК-полимеразы ретровирусов заключается в том, что ее природными матрицами являются молекулы РНК. Однако для реакции обратной транскрипции присутствия матрицы недостаточно. Образование провируса происходит лишь в том случае, если в реакции участвуют соответствующие молекулы РНК-затравки (Harada F. et al. , 1979; Varmus H. et al. , 1979; Gerard G. , Grandgenett D. , 1980].
Как и все известные ДНК-полимеразы, обратная транскриптаза представляет собой функционально «затравказависимый» фермент. Наиболее эффективными затравками для действия фермента оказались синтетические гомополимерные матрицы (олигодезоксирибонуклеотиды), например поли (рЦ), олиго (дГ) и некоторые другие [Gerard G. , Grandgenett D. , 1980; Varmus H. , Swanstrom R. , 1982]. Естественными же затравками для работы фермента служат определенные тРНК. In vitro в различных системах обратной транскрипции иРНК вирусов и клеток эукариотов могут использоваться уникальные структурные свойства самих матриц для получения ДНК транскрипта с их определенного участка. Так, наличие полиаденилатного тракта на З'-конце иРНК позволяет в присутствии затравки олиго (дТ) синтезировать гетерополимерные участки, следующие за поли (An) [Gerard G. , Grandgenett D. , 1980; Boone L. , Skalka A. , 1981]. Широкоиспользуемой затравкой для синтеза высокопредставительной копии гетерологичных иРНК служат олигонуклеотиды ДНК тимуса теленка (статистические, усредненные, «rendom primers»).

Большое влияние на процесс транскрипции матрицы оказывают очистка ДНК-полимеразы от РНКаз, гидролизующих матрицу, и концентрации каждого дезоксирибонуклеозидтрифосфата в реакции |Varmus H. et al. , 1979; Gerard G. , Grandgenett D. , 1980].

Функциональная роль РНКазы Н в системе ДНК провируса in vitro и in vivo изучена в меньшей степени. В последнее время с функцией РНКазы Н стали связывать деградацию РНК-матрицы