Репликация ретровирусов

R Cl_s                                                                          _ U₃ R

5' Cap —Ш-----------------------------П-----------------------------1'             ■— An 3'

Гены вирионной РНК

ip                    ip                                                                      Ф                      'P

у r^mu*------------------------e------------------------> i;-';::. i

Линейная ДНК                       '---------v

\

LTR

LTR Соединение двух LTR в кольцевой ДНК

dp                                                                                                                                          dp

клеточ-—»             1:"71                                   \\                                   Г            ■ : Д—- клеточ-

ная ДНК Промотер                            Провирусная ДНК                                                       ная ДНК

1

-<г-

Вирусная РНК

Рис. 3. Структура (а) субъединицы геномной РНК ретровнрусов и схема (б) репродукции через ДНК-провирус [Coffin J. . 1980; Varmus H. , Swanstrom R. , 1982J

5'Cap — кэппируюшая группа; АпЗ' — полиаденилатный тракт; R — короткие последовательности; U₅ — уникальные последовательности 5'-коица, которые располагаются между РВ(—) и R: 0₈ - уинкальиые последовательности З'-коииа, расположенные между РВ( + ) и R; ip — инвертированные повторы, обрамляюшие LTR с двух сторон; dp — прямые повторы клеточной ДНК (4—6 п. о. ) представлены единичной копией в «неоккупнроваи-иом» сайте интеграции; детали размеров областей генома ретровнрусов и их вариации

даиы в тексте.

ной молекулы вирусной ДНК, повторяются в одинаковой ориентации (концы 5' и 3' однонаправлены). Они получили название длинных концевых повторов — LTR [Coffin J. , 1982; Temin H. , 1982; Varmus H. , Swanstrom R. , 1982]. LTR содержат последовательности, происходящие из гетерополимерных участков 5'- и З'-концов вирусной субъединицы РНК (рис. 3).
Как видно из рис. 3, в LTR представлены: нуклеотидные последовательности длиной 250—1200 пар оснований (п. о. ), комплементарные уникальной области З'-конца вирионной РНК (Уз-последователь-ности); короткая единичная копия R-последовательности, обнаруженная на обоих концах вирусной РНК, и участок длиной 80—120 п. о. уникальной области 5'-конца (ив-последователь-ности).

Размеры областей U₃ и U₅ значительно варьируют у ретро-вирусов разных видов животных. U₅ граничит в З'-направленин с участком (сайтом), определяющим начало синтеза ( —)-цепи ДНК, а в 5'-направлении — с R. U₃ граничит в 5'-направлении с участком (сайтом), определяющим начало синтеза (-|-)-цепи вирусной ДНК, а на З'-направлении с R (см. рис. 3). Схематическое расположение LTR в линейном провирусе можно представить следующим образом: U₃RU₅ — вирусные гены — U₃RU₅ JKung H. et al. , 1981; Varmus H. , Swanstrom R. , 1982]. Секвени-рование клонированных последовательностей LTR показало, что

.